L'office d'organisation concrétise le programme vitamine, un projet transversal visant à regrouper un millier de titulaires de l'adminstration sur deux sites, à Neuchâtel et à la Chaux-de-Fonds.
Il mène et soutien des projets de transformation visant à améliorer l'efficience de l'administration.
En tant que centre de compétences, l'office d'organisation accompagnent les services dans la gestion de leurs projets.
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